La historia involucra a un científico loco, el Doctor Hell, quien descubre tecnología robótica perdida y la usa para crear robots gigantes con los cuales gobernar el mundo. El Doctor Juzo Kabuto descubre ésto, y escapa a su captura. Kabuto se prepara entonces para la inminente invasión con dos descubrimientos científicos: la energía Foto-Atómica y la Super Aleación Z, procesada del Japanium (un nuevo elemento científico extraído del Monte Fuji, en Japón). Sin que nadie supiese, el Doctor Kabuto crea al robot gigante Mazinger Z en base a la aleación del Japanium. El teniente de las fuerzas del Doctor Hell, Baron Assler, destruye la villa en la montaña del Doctor Kabuto, pero no sin antes que el Doctor Kabuto contactara a su nieto Koji Kabuto para pedir de su ayuda. Koji descubre el laboratorio secreto de su abuelo, y por consiguiente, a Mazinger Z.
